Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F3O00716 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F3O00716 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F3O00716 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F3O00716 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2F3O00716 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F3O00716 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F3O00716 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F3O00716 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F3O00716 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F3O00716 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F3O00716 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F3O00716 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F3O00716 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F3O00716 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F3O00716 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F3O00716 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F3O00716 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F3O00716 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F3O00716 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F3O00716 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F3O00716 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F3O00716 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F3O00716 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F3O00716 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F3O00716 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F3O00716 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F3O00716 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F3O00716 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F3O00716 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F3O00716 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F3O00716 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F3O00716 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F3O00716 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F3O00716 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F3O00716 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F3O00716 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F3O00716 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F3O00716 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F3O00716 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F3O00716 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F3O00716 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F3O00716 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F3O00716 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F3O00716 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F3O00716 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F3O00716 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F3O00716 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F3O00716 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F3O00716 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F3O00716 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F3O00716 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F3O00716 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F3O00716 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F3O00716 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F3O00716 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F3O00716 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F3O00716 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F3O00716 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F3O00716 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F3O00716 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F3O00716 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F3O00716 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F3O00716 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F3O00716 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F3O00716 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F3O00716 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F3O00716 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F3O00716 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F3O00716 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F3O00716 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F3O00716 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F3O00716 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F3O00716 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F3O00716 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F3O00716 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F3O00716 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F3O00716 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F3O00716 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F3O00716 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F3O00716 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F3O00716 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F3O00716 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F3O00716 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F3O00716 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F3O00716 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F3O00716 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F3O00716 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F3O00716 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F3O00716 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F3O00716 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F3O00716 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F3O00716 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F3O00716 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F3O00716 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F3O00716 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F3O00716 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F3O00716 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F3O00716 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F3O00716 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms