Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX7O00628 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX7O00628 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX7O00628 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX7O00628 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX7O00628 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX7O00628 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX7O00628 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX7O00628 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX7O00628 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX7O00628 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX7O00628 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX7O00628 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX7O00628 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX7O00628 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX7O00628 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX7O00628 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX7O00628 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX7O00628 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX7O00628 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX7O00628 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX7O00628 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX7O00628 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX7O00628 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX7O00628 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX7O00628 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX7O00628 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX7O00628 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX7O00628 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX7O00628 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX7O00628 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX7O00628 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX7O00628 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX7O00628 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX7O00628 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX7O00628 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX7O00628 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX7O00628 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX7O00628 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX7O00628 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX7O00628 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX7O00628 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX7O00628 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX7O00628 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX7O00628 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX7O00628 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX7O00628 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX7O00628 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX7O00628 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX7O00628 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX7O00628 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX7O00628 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX7O00628 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX7O00628 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX7O00628 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX7O00628 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX7O00628 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX7O00628 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX7O00628 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms