Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFRD1O00458 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFRD1O00458 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFRD1O00458 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms