Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC7O00311 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC7O00311 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC7O00311 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC7O00311 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC7O00311 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC7O00311 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC7O00311 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC7O00311 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC7O00311 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC7O00311 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC7O00311 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC7O00311 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC7O00311 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC7O00311 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC7O00311 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC7O00311 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC7O00311 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC7O00311 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC7O00311 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC7O00311 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC7O00311 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC7O00311 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC7O00311 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC7O00311 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC7O00311 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC7O00311 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC7O00311 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC7O00311 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC7O00311 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC7O00311 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC7O00311 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC7O00311 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC7O00311 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC7O00311 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC7O00311 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC7O00311 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC7O00311 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC7O00311 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC7O00311 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC7O00311 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC7O00311 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC7O00311 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC7O00311 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC7O00311 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC7O00311 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC7O00311 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC7O00311 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC7O00311 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC7O00311 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC7O00311 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC7O00311 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC7O00311 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC7O00311 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC7O00311 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC7O00311 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC7O00311 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC7O00311 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC7O00311 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC7O00311 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC7O00311 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC7O00311 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC7O00311 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC7O00311 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC7O00311 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC7O00311 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC7O00311 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC7O00311 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC7O00311 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC7O00311 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC7O00311 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC7O00311 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC7O00311 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC7O00311 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC7O00311 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC7O00311 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC7O00311 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC7O00311 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC7O00311 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC7O00311 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC7O00311 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC7O00311 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC7O00311 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC7O00311 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC7O00311 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC7O00311 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC7O00311 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC7O00311 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC7O00311 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC7O00311 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms