Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1D1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1D1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1D1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1D1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1D1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1D1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
H7C1D1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
H7C1D1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
H7C1D1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1D1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1D1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1D1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1D1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1D1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1D1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1D1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1D1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1D1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1D1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
H7C1D1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
H7C1D1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
H7C1D1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
H7C1D1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
H7C1D1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
H7C1D1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
H7C1D1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
H7C1D1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
H7C1D1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
H7C1D1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
H7C1D1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1D1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1D1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1D1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1D1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1D1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1D1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1D1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1D1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1D1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1D1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1D1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1D1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1D1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1D1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1D1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1D1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
H7C1D1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
H7C1D1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1D1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1D1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1D1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1D1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1D1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1D1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1D1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1D1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1D1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1D1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1D1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1D1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1D1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1D1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1D1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1D1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1D1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1D1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1D1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1D1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1D1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1D1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1D1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
H7C1D1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
H7C1D1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
H7C1D1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
H7C1D1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
H7C1D1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
H7C1D1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
H7C1D1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
H7C1D1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
H7C1D1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
H7C1D1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
H7C1D1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
H7C1D1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
H7C1D1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
H7C1D1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
H7C1D1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
H7C1D1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
H7C1D1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
H7C1D1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
H7C1D1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
H7C1D1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
H7C1D1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
H7C1D1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
H7C1D1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
H7C1D1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
H7C1D1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
H7C1D1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
H7C1D1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
H7C1D1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms