Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TMX2-CTNND1H3BSU7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms