Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BMM5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BMM5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BMM5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BMM5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BMM5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BMM5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BMM5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BMM5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BMM5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BMM5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BMM5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BMM5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BMM5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BMM5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BMM5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BMM5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BMM5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BMM5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BMM5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BMM5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BMM5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BMM5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BMM5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BMM5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
H3BMM5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H3BMM5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BMM5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BMM5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BMM5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BMM5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BMM5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BMM5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BMM5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BMM5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BMM5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BMM5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BMM5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BMM5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BMM5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BMM5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BMM5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BMM5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BMM5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BMM5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BMM5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BMM5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BMM5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BMM5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BMM5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BMM5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BMM5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BMM5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BMM5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BMM5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BMM5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BMM5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BMM5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BMM5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BMM5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BMM5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BMM5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BMM5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BMM5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BMM5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BMM5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BMM5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BMM5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BMM5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BMM5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BMM5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BMM5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BMM5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BMM5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BMM5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BMM5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BMM5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BMM5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BMM5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BMM5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BMM5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BMM5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BMM5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BMM5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BMM5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BMM5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BMM5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BMM5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BMM5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BMM5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms