Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM1B2RUZ4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms