Protein–RNA interactions for Protein: A6NKU9

SPDYE3, Speedy protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE3A6NKU9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPDYE3A6NKU9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPDYE3A6NKU9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SPDYE3A6NKU9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms