Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85CA6NKD9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85CA6NKD9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85CA6NKD9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms