Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNX2A6NKB5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNX2A6NKB5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms