Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM247A6NEH6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM247A6NEH6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms