Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LCHNA4D1U4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCHNA4D1U4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LCHNA4D1U4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms