Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF27A3QJZ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms