Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3PXD2BA1X283 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3PXD2BA1X283 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms