Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN11A1L157 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN11A1L157 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN11A1L157 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN11A1L157 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN11A1L157 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN11A1L157 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN11A1L157 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN11A1L157 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN11A1L157 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms