Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPD8

KDM4F, Lysine demethylase 4F, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4FA0A1W2PPD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM4FA0A1W2PPD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM4FA0A1W2PPD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
KDM4FA0A1W2PPD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM4FA0A1W2PPD8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM4FA0A1W2PPD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM4FA0A1W2PPD8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
KDM4FA0A1W2PPD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM4FA0A1W2PPD8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM4FA0A1W2PPD8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms