Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
A0A1B0GVL5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1B0GVL5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms