Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0U1RQJ8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQJ8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms