Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G6

TRBV10-3, T-cell receptor beta variable 10-3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV10-3A0A0K0K1G6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms