Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2C4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2C4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0B4J2C4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms