Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms