Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1070.1 ms