Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms