Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms