Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAB39Q9Y376 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms