Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERGIC3Q9Y282 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms