Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms