Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF24Q9UPV7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms