Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR3Q9UNL2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms