Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP25Q9UHP3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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