Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms