Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MLH3Q9UHC1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms