Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT172Q9UG01 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms