Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms