Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MBD5Q9P267 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms