Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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