Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms