Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms