Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARVAQ9NVD7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms