Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms