Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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