Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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