Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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