Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7BQ9NP56 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms