Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms