Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD3Q9BZ95 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms