Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms