Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms