Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNDC11Q9BVV2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNDC11Q9BVV2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNDC11Q9BVV2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNDC11Q9BVV2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNDC11Q9BVV2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNDC11Q9BVV2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNDC11Q9BVV2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms